Fundação Esperança iniciou suas atividades em 1969, com a chegada de Frei Lucas Tupper, um médico americano e padre da Ordem Franciscana. Sua escolha por Santarém, uma pequena comunidade na Amazônia e Rios Tapajós, não foi por acidente, uma vez que a Diocese de Santarém foi da Ordem Franciscana. Naquela época, a cidade tinha poucos médicos e não havia serviços médicos disponíveis ou saneamento nas comunidades ribeirinhas. Muitas crianças morriam de poliomielite, tétano, difteria e vermes intestinais antes de seu segundo aniversário. Frei Lucas, como era chamado no local, sabia que a maioria dessas doenças poderia ser evitada através do uso de vacinas e educação sanitária. Com a ajuda da igreja e da comunidade, ele construiu a Clínica dos Pobres e, em seguida, com a ajuda de Esperança Incorporated nos Estados Unidos, um barco hospital foi construído para apoiar o programa e as comunidades ribeirinhas.

Médicos voluntários e equipes cirúrgicas vieram. Depois da morte de Frei Lucas, em 1978, uma organização sem fins lucrativos chamada Fundação Esperança (Esperança Foundation) foi formada sobre estatutos brasileiras. A moderna estrutura física foi posta em prática com a ajuda de ASHA, das Escolas e Hospitais Americanos de USAID. A organização continua a prestar serviços de saúde para o povo de Santarém e região. Foi quando expandiu sua missão e incluiu a educação através de uma escola profissionalizante chamada CEPES e um Instituto de Ensino Superior Esperança, chamado IESPES. A Fundação Esperança tem sua missão, de melhorar a condição de vida da população através do uso da educação, extensão e pesquisa, serviços de saúde, e tecnologia da Informação na Região Amazônica.